Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RABGEF1Q9UJ41 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RABGEF1Q9UJ41 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RABGEF1Q9UJ41 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RABGEF1Q9UJ41 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
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RABGEF1Q9UJ41 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RABGEF1Q9UJ41 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RABGEF1Q9UJ41 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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RABGEF1Q9UJ41 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RABGEF1Q9UJ41 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RABGEF1Q9UJ41 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RABGEF1Q9UJ41 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RABGEF1Q9UJ41 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RABGEF1Q9UJ41 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RABGEF1Q9UJ41 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RABGEF1Q9UJ41 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RABGEF1Q9UJ41 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RABGEF1Q9UJ41 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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RABGEF1Q9UJ41 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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RABGEF1Q9UJ41 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
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RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RABGEF1Q9UJ41 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RABGEF1Q9UJ41 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RABGEF1Q9UJ41 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RABGEF1Q9UJ41 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RABGEF1Q9UJ41 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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