Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ZBED3Q96IU2 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ZBED3Q96IU2 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZBED3Q96IU2 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
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