Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USP49Q70CQ1 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USP49Q70CQ1 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USP49Q70CQ1 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USP49Q70CQ1 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USP49Q70CQ1 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USP49Q70CQ1 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USP49Q70CQ1 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USP49Q70CQ1 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USP49Q70CQ1 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USP49Q70CQ1 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USP49Q70CQ1 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USP49Q70CQ1 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USP49Q70CQ1 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USP49Q70CQ1 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USP49Q70CQ1 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USP49Q70CQ1 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USP49Q70CQ1 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USP49Q70CQ1 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USP49Q70CQ1 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USP49Q70CQ1 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USP49Q70CQ1 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USP49Q70CQ1 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USP49Q70CQ1 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USP49Q70CQ1 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USP49Q70CQ1 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USP49Q70CQ1 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USP49Q70CQ1 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USP49Q70CQ1 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USP49Q70CQ1 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USP49Q70CQ1 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
USP49Q70CQ1 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
USP49Q70CQ1 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.6 ms