Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZBED9Q6R2W3 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZBED9Q6R2W3 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZBED9Q6R2W3 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZBED9Q6R2W3 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZBED9Q6R2W3 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ZBED9Q6R2W3 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ZBED9Q6R2W3 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED9Q6R2W3 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED9Q6R2W3 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED9Q6R2W3 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED9Q6R2W3 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ZBED9Q6R2W3 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
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