Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNAPC1Q16533 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNAPC1Q16533 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNAPC1Q16533 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SNAPC1Q16533 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNAPC1Q16533 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNAPC1Q16533 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNAPC1Q16533 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNAPC1Q16533 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNAPC1Q16533 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SNAPC1Q16533 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SNAPC1Q16533 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SNAPC1Q16533 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SNAPC1Q16533 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNAPC1Q16533 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNAPC1Q16533 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNAPC1Q16533 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNAPC1Q16533 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNAPC1Q16533 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNAPC1Q16533 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNAPC1Q16533 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNAPC1Q16533 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SNAPC1Q16533 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SNAPC1Q16533 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.9 ms