Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SIX1Q15475 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SIX1Q15475 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SIX1Q15475 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SIX1Q15475 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.9 ms