Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TTF1Q15361 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TTF1Q15361 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TTF1Q15361 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TTF1Q15361 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TTF1Q15361 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TTF1Q15361 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TTF1Q15361 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TTF1Q15361 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TTF1Q15361 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TTF1Q15361 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TTF1Q15361 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TTF1Q15361 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TTF1Q15361 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TTF1Q15361 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TTF1Q15361 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TTF1Q15361 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TTF1Q15361 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TTF1Q15361 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TTF1Q15361 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TTF1Q15361 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TTF1Q15361 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TTF1Q15361 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TTF1Q15361 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TTF1Q15361 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TTF1Q15361 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TTF1Q15361 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TTF1Q15361 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TTF1Q15361 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TTF1Q15361 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.7 ms