Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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SNX17Q15036 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX17Q15036 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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SNX17Q15036 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
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SNX17Q15036 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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SNX17Q15036 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SNX17Q15036 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX17Q15036 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX17Q15036 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SNX17Q15036 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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