Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SCARB2Q14108 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SCARB2Q14108 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SCARB2Q14108 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SCARB2Q14108 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SCARB2Q14108 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SCARB2Q14108 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SCARB2Q14108 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.93□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SCARB2Q14108 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SCARB2Q14108 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SCARB2Q14108 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SCARB2Q14108 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SCARB2Q14108 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SCARB2Q14108 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SCARB2Q14108 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SCARB2Q14108 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SCARB2Q14108 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCARB2Q14108 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCARB2Q14108 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SCARB2Q14108 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SCARB2Q14108 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SCARB2Q14108 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SCARB2Q14108 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SCARB2Q14108 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SCARB2Q14108 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCARB2Q14108 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SCARB2Q14108 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SCARB2Q14108 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SCARB2Q14108 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SCARB2Q14108 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
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