Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SQSTM1Q13501 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SQSTM1Q13501 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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SQSTM1Q13501 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SQSTM1Q13501 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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SQSTM1Q13501 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SQSTM1Q13501 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SQSTM1Q13501 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SQSTM1Q13501 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SQSTM1Q13501 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SQSTM1Q13501 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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SQSTM1Q13501 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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SQSTM1Q13501 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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SQSTM1Q13501 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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SQSTM1Q13501 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SQSTM1Q13501 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SQSTM1Q13501 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SQSTM1Q13501 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SQSTM1Q13501 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SQSTM1Q13501 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SQSTM1Q13501 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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