Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
RPA4Q13156 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
RPA4Q13156 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
RPA4Q13156 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
RPA4Q13156 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
RPA4Q13156 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
RPA4Q13156 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
RPA4Q13156 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
RPA4Q13156 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
RPA4Q13156 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
RPA4Q13156 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
RPA4Q13156 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
RPA4Q13156 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
RPA4Q13156 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
RPA4Q13156 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
RPA4Q13156 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
RPA4Q13156 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
RPA4Q13156 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.1 ms