Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
FOXD4Q12950 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
FOXD4Q12950 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
FOXD4Q12950 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
FOXD4Q12950 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
FOXD4Q12950 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
FOXD4Q12950 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
FOXD4Q12950 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
FOXD4Q12950 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
FOXD4Q12950 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
FOXD4Q12950 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 274.5 ms