Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
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FOXF1Q12946 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
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FOXF1Q12946 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
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FOXF1Q12946 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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FOXF1Q12946 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
FOXF1Q12946 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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FOXF1Q12946 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
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FOXF1Q12946 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
FOXF1Q12946 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
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