Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXA4Q00056 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HOXA4Q00056 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
HOXA4Q00056 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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HOXA4Q00056 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HOXA4Q00056 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXA4Q00056 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXA4Q00056 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXA4Q00056 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HOXA4Q00056 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXA4Q00056 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXA4Q00056 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXA4Q00056 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXA4Q00056 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXA4Q00056 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXA4Q00056 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXA4Q00056 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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