Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
LINC00205P59089 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00205P59089 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00205P59089 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00205P59089 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00205P59089 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LINC00205P59089 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LINC00205P59089 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LINC00205P59089 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LINC00205P59089 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LINC00205P59089 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249.3 ms