Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMEM260Q9NX78 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.32□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMEM260Q9NX78 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TMEM260Q9NX78 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TMEM260Q9NX78 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TMEM260Q9NX78 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TMEM260Q9NX78 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TMEM260Q9NX78 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TMEM260Q9NX78 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TMEM260Q9NX78 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TMEM260Q9NX78 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TMEM260Q9NX78 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TMEM260Q9NX78 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TMEM260Q9NX78 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TMEM260Q9NX78 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 313 ms