Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
TRIM4Q9C037 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
TRIM4Q9C037 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-2.7□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
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TRIM4Q9C037 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
TRIM4Q9C037 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
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