Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT9

GINS4, DNA replication complex GINS protein SLD5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.4□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
GINS4Q9BRT9 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.42□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
GINS4Q9BRT9 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
GINS4Q9BRT9 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
GINS4Q9BRT9 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
GINS4Q9BRT9 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
GINS4Q9BRT9 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
GINS4Q9BRT9 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
GINS4Q9BRT9 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.55□□□□□ -2.82
GINS4Q9BRT9 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
GINS4Q9BRT9 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
GINS4Q9BRT9 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
GINS4Q9BRT9 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
GINS4Q9BRT9 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
GINS4Q9BRT9 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.2 ms