Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
C9orf72Q96LT7 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
C9orf72Q96LT7 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-2.13□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
C9orf72Q96LT7 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
C9orf72Q96LT7 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
C9orf72Q96LT7 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
C9orf72Q96LT7 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
C9orf72Q96LT7 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
C9orf72Q96LT7 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
C9orf72Q96LT7 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
C9orf72Q96LT7 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
C9orf72Q96LT7 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
C9orf72Q96LT7 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
C9orf72Q96LT7 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-2.25□□□□□ -2.77
C9orf72Q96LT7 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
C9orf72Q96LT7 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
C9orf72Q96LT7 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.27□□□□□ -2.77
C9orf72Q96LT7 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
C9orf72Q96LT7 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
C9orf72Q96LT7 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
C9orf72Q96LT7 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
C9orf72Q96LT7 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
C9orf72Q96LT7 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
C9orf72Q96LT7 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
C9orf72Q96LT7 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
C9orf72Q96LT7 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
C9orf72Q96LT7 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
C9orf72Q96LT7 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
C9orf72Q96LT7 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
C9orf72Q96LT7 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
C9orf72Q96LT7 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.31□□□□□ -2.78
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
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