Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RIN3Q8TB24 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RIN3Q8TB24 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RIN3Q8TB24 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RIN3Q8TB24 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RIN3Q8TB24 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIN3Q8TB24 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIN3Q8TB24 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIN3Q8TB24 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIN3Q8TB24 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIN3Q8TB24 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIN3Q8TB24 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIN3Q8TB24 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIN3Q8TB24 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIN3Q8TB24 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIN3Q8TB24 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIN3Q8TB24 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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RIN3Q8TB24 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIN3Q8TB24 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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RIN3Q8TB24 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
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RIN3Q8TB24 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIN3Q8TB24 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIN3Q8TB24 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIN3Q8TB24 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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RIN3Q8TB24 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RIN3Q8TB24 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RIN3Q8TB24 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RIN3Q8TB24 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RIN3Q8TB24 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIN3Q8TB24 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIN3Q8TB24 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIN3Q8TB24 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIN3Q8TB24 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIN3Q8TB24 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIN3Q8TB24 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIN3Q8TB24 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
RIN3Q8TB24 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
RIN3Q8TB24 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RIN3Q8TB24 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
RIN3Q8TB24 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RIN3Q8TB24 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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