Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC142Q17RM4 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CCDC142Q17RM4 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC142Q17RM4 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC142Q17RM4 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC142Q17RM4 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CCDC142Q17RM4 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CCDC142Q17RM4 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CCDC142Q17RM4 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CCDC142Q17RM4 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CCDC142Q17RM4 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CCDC142Q17RM4 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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CCDC142Q17RM4 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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CCDC142Q17RM4 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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CCDC142Q17RM4 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CCDC142Q17RM4 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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CCDC142Q17RM4 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CCDC142Q17RM4 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CCDC142Q17RM4 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CCDC142Q17RM4 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC142Q17RM4 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC142Q17RM4 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC142Q17RM4 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC142Q17RM4 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC142Q17RM4 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC142Q17RM4 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC142Q17RM4 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC142Q17RM4 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CCDC142Q17RM4 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC142Q17RM4 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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CCDC142Q17RM4 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CCDC142Q17RM4 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC142Q17RM4 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC142Q17RM4 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC142Q17RM4 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC142Q17RM4 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC142Q17RM4 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC142Q17RM4 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CCDC142Q17RM4 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC142Q17RM4 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC142Q17RM4 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC142Q17RM4 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC142Q17RM4 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC142Q17RM4 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
CCDC142Q17RM4 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
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