Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NDUFA9Q16795 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NDUFA9Q16795 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NDUFA9Q16795 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NDUFA9Q16795 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NDUFA9Q16795 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NDUFA9Q16795 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NDUFA9Q16795 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NDUFA9Q16795 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NDUFA9Q16795 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NDUFA9Q16795 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NDUFA9Q16795 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NDUFA9Q16795 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NDUFA9Q16795 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NDUFA9Q16795 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NDUFA9Q16795 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NDUFA9Q16795 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NDUFA9Q16795 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NDUFA9Q16795 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NDUFA9Q16795 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NDUFA9Q16795 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NDUFA9Q16795 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NDUFA9Q16795 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
NDUFA9Q16795 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
NDUFA9Q16795 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.2 ms