Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-1.66□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SCN9AQ15858 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
SCN9AQ15858 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SCN9AQ15858 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SCN9AQ15858 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SCN9AQ15858 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
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