Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NR1I3Q14994 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NR1I3Q14994 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NR1I3Q14994 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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NR1I3Q14994 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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NR1I3Q14994 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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NR1I3Q14994 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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NR1I3Q14994 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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NR1I3Q14994 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NR1I3Q14994 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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NR1I3Q14994 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NR1I3Q14994 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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