Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SMCO1Q147U7 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SMCO1Q147U7 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SMCO1Q147U7 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SMCO1Q147U7 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SMCO1Q147U7 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SMCO1Q147U7 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SMCO1Q147U7 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-4.04□□□□□ -3.06
SMCO1Q147U7 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SMCO1Q147U7 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
SMCO1Q147U7 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
SMCO1Q147U7 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
SMCO1Q147U7 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
SMCO1Q147U7 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
SMCO1Q147U7 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
SMCO1Q147U7 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SMCO1Q147U7 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SMCO1Q147U7 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
SMCO1Q147U7 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-4.19□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SMCO1Q147U7 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
SMCO1Q147U7 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
SMCO1Q147U7 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
SMCO1Q147U7 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
SMCO1Q147U7 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
SMCO1Q147U7 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
SMCO1Q147U7 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SMCO1Q147U7 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SMCO1Q147U7 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SMCO1Q147U7 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SMCO1Q147U7 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SMCO1Q147U7 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SMCO1Q147U7 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SMCO1Q147U7 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
SMCO1Q147U7 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 248.9 ms