Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SMC1AQ14683 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SMC1AQ14683 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SMC1AQ14683 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMC1AQ14683 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SMC1AQ14683 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SMC1AQ14683 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMC1AQ14683 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
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