Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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COL9A3Q14050 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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COL9A3Q14050 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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COL9A3Q14050 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL9A3Q14050 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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COL9A3Q14050 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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COL9A3Q14050 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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COL9A3Q14050 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
COL9A3Q14050 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
COL9A3Q14050 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
COL9A3Q14050 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
COL9A3Q14050 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
COL9A3Q14050 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
COL9A3Q14050 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
COL9A3Q14050 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
COL9A3Q14050 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
COL9A3Q14050 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
COL9A3Q14050 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
COL9A3Q14050 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
COL9A3Q14050 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
COL9A3Q14050 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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