Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
RIPK1Q13546 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RIPK1Q13546 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RIPK1Q13546 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RIPK1Q13546 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RIPK1Q13546 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RIPK1Q13546 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
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