Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MKRN4PQ13434 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
MKRN4PQ13434 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MKRN4PQ13434 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MKRN4PQ13434 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MKRN4PQ13434 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
MKRN4PQ13434 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
MKRN4PQ13434 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MKRN4PQ13434 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MKRN4PQ13434 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MKRN4PQ13434 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MKRN4PQ13434 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MKRN4PQ13434 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MKRN4PQ13434 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MKRN4PQ13434 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MKRN4PQ13434 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MKRN4PQ13434 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MKRN4PQ13434 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
MKRN4PQ13434 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MKRN4PQ13434 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MKRN4PQ13434 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MKRN4PQ13434 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MKRN4PQ13434 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MKRN4PQ13434 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MKRN4PQ13434 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MKRN4PQ13434 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MKRN4PQ13434 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MKRN4PQ13434 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MKRN4PQ13434 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MKRN4PQ13434 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MKRN4PQ13434 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MKRN4PQ13434 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MKRN4PQ13434 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MKRN4PQ13434 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MKRN4PQ13434 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MKRN4PQ13434 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MKRN4PQ13434 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MKRN4PQ13434 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MKRN4PQ13434 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
MKRN4PQ13434 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MKRN4PQ13434 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
MKRN4PQ13434 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MKRN4PQ13434 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MKRN4PQ13434 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
MKRN4PQ13434 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
MKRN4PQ13434 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MKRN4PQ13434 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
MKRN4PQ13434 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MKRN4PQ13434 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MKRN4PQ13434 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MKRN4PQ13434 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MKRN4PQ13434 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MKRN4PQ13434 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MKRN4PQ13434 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
MKRN4PQ13434 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MKRN4PQ13434 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MKRN4PQ13434 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
MKRN4PQ13434 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MKRN4PQ13434 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MKRN4PQ13434 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MKRN4PQ13434 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MKRN4PQ13434 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
MKRN4PQ13434 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MKRN4PQ13434 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
MKRN4PQ13434 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
MKRN4PQ13434 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
MKRN4PQ13434 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
MKRN4PQ13434 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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