Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
FOXD4Q12950 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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FOXD4Q12950 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
FOXD4Q12950 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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FOXD4Q12950 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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FOXD4Q12950 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
FOXD4Q12950 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
FOXD4Q12950 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
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