Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
FOXF1Q12946 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
FOXF1Q12946 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.3 ms