Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRXP46100 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRXP46100 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRXP46100 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRXP46100 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRXP46100 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ATRXP46100 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRXP46100 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRXP46100 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRXP46100 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ATRXP46100 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRXP46100 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRXP46100 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRXP46100 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRXP46100 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRXP46100 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRXP46100 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRXP46100 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRXP46100 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRXP46100 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRXP46100 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ATRXP46100 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRXP46100 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRXP46100 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRXP46100 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRXP46100 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRXP46100 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRXP46100 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRXP46100 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRXP46100 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ATRXP46100 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRXP46100 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRXP46100 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRXP46100 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRXP46100 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRXP46100 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRXP46100 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRXP46100 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ATRXP46100 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRXP46100 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ATRXP46100 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRXP46100 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRXP46100 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRXP46100 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRXP46100 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRXP46100 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRXP46100 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRXP46100 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATRXP46100 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ATRXP46100 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ATRXP46100 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ATRXP46100 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ATRXP46100 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ATRXP46100 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ATRXP46100 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRXP46100 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRXP46100 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRXP46100 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATRXP46100 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRXP46100 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRXP46100 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRXP46100 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRXP46100 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRXP46100 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATRXP46100 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRXP46100 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRXP46100 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRXP46100 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRXP46100 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRXP46100 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRXP46100 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRXP46100 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRXP46100 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRXP46100 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRXP46100 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRXP46100 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRXP46100 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRXP46100 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRXP46100 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRXP46100 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRXP46100 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRXP46100 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRXP46100 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRXP46100 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRXP46100 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRXP46100 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRXP46100 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRXP46100 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRXP46100 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRXP46100 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRXP46100 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRXP46100 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRXP46100 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRXP46100 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRXP46100 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRXP46100 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRXP46100 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRXP46100 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRXP46100 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRXP46100 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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