Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms