Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhoP15409 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhoP15409 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhoP15409 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhoP15409 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhoP15409 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhoP15409 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhoP15409 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhoP15409 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RhoP15409 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RhoP15409 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms