Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHOC2Q9UQ13 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHOC2Q9UQ13 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 317.7 ms