Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FAM53CQ9NYF3 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM53CQ9NYF3 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FAM53CQ9NYF3 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FAM53CQ9NYF3 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FAM53CQ9NYF3 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FAM53CQ9NYF3 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM53CQ9NYF3 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM53CQ9NYF3 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM53CQ9NYF3 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM53CQ9NYF3 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM53CQ9NYF3 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM53CQ9NYF3 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM53CQ9NYF3 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 319.5 ms