Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
C9orf47Q6ZRZ4 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C9orf47Q6ZRZ4 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.2 ms