Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZIC1Q15915 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ZIC1Q15915 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ZIC1Q15915 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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