Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
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PTPRKQ15262 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRKQ15262 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
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PTPRKQ15262 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
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PTPRKQ15262 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
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PTPRKQ15262 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PTPRKQ15262 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
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PTPRKQ15262 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRKQ15262 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRKQ15262 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRKQ15262 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PTPRKQ15262 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PTPRKQ15262 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
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PTPRKQ15262 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
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