Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-3.79□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-3.84□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SMCO1Q147U7 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SMCO1Q147U7 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-3.96□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SMCO1Q147U7 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SMCO1Q147U7 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
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