Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
APOFQ13790 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
APOFQ13790 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
APOFQ13790 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
APOFQ13790 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
APOFQ13790 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
APOFQ13790 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
APOFQ13790 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
APOFQ13790 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
APOFQ13790 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
APOFQ13790 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
APOFQ13790 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
APOFQ13790 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
APOFQ13790 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
APOFQ13790 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
APOFQ13790 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
APOFQ13790 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
APOFQ13790 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
APOFQ13790 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
APOFQ13790 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
APOFQ13790 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
APOFQ13790 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
APOFQ13790 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
APOFQ13790 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
APOFQ13790 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
APOFQ13790 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
APOFQ13790 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
APOFQ13790 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
APOFQ13790 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
APOFQ13790 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
APOFQ13790 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
APOFQ13790 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
APOFQ13790 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
APOFQ13790 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
APOFQ13790 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
APOFQ13790 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
APOFQ13790 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
APOFQ13790 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
APOFQ13790 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
APOFQ13790 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
APOFQ13790 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
APOFQ13790 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
APOFQ13790 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
APOFQ13790 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
APOFQ13790 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
APOFQ13790 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
APOFQ13790 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
APOFQ13790 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
APOFQ13790 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
APOFQ13790 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
APOFQ13790 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
APOFQ13790 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
APOFQ13790 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
APOFQ13790 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
APOFQ13790 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
APOFQ13790 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
APOFQ13790 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
APOFQ13790 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
APOFQ13790 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
APOFQ13790 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
APOFQ13790 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
APOFQ13790 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
APOFQ13790 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
APOFQ13790 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
APOFQ13790 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
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APOFQ13790 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
APOFQ13790 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
APOFQ13790 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
APOFQ13790 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
APOFQ13790 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
APOFQ13790 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
APOFQ13790 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
APOFQ13790 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
APOFQ13790 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
APOFQ13790 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
APOFQ13790 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
APOFQ13790 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
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APOFQ13790 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
APOFQ13790 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
APOFQ13790 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
APOFQ13790 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
APOFQ13790 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
APOFQ13790 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
APOFQ13790 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
APOFQ13790 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
APOFQ13790 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
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APOFQ13790 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
APOFQ13790 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
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APOFQ13790 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
APOFQ13790 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
APOFQ13790 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
APOFQ13790 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
APOFQ13790 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
APOFQ13790 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
APOFQ13790 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
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