Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
MTA1Q13330 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
MTA1Q13330 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
MTA1Q13330 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
MTA1Q13330 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
MTA1Q13330 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
MTA1Q13330 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MTA1Q13330 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
MTA1Q13330 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.5 ms