Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHRNEQ04844 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHRNEQ04844 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHRNEQ04844 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHRNEQ04844 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHRNEQ04844 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHRNEQ04844 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CHRNEQ04844 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHRNEQ04844 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHRNEQ04844 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHRNEQ04844 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHRNEQ04844 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHRNEQ04844 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHRNEQ04844 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHRNEQ04844 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHRNEQ04844 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHRNEQ04844 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 411.1 ms