Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
RABGEF1Q9UJ41 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RABGEF1Q9UJ41 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RABGEF1Q9UJ41 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RABGEF1Q9UJ41 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RABGEF1Q9UJ41 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RABGEF1Q9UJ41 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RABGEF1Q9UJ41 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RABGEF1Q9UJ41 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RABGEF1Q9UJ41 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RABGEF1Q9UJ41 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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