Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.65□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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