Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEL0

CCDC54, Coiled-coil domain-containing protein 54, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC54Q8NEL0 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCDC54Q8NEL0 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCDC54Q8NEL0 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCDC54Q8NEL0 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCDC54Q8NEL0 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCDC54Q8NEL0 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCDC54Q8NEL0 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC54Q8NEL0 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC54Q8NEL0 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC54Q8NEL0 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC54Q8NEL0 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCDC54Q8NEL0 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CCDC54Q8NEL0 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC54Q8NEL0 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC54Q8NEL0 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCDC54Q8NEL0 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
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