Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USP49Q70CQ1 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USP49Q70CQ1 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USP49Q70CQ1 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USP49Q70CQ1 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USP49Q70CQ1 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USP49Q70CQ1 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USP49Q70CQ1 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USP49Q70CQ1 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USP49Q70CQ1 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USP49Q70CQ1 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USP49Q70CQ1 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USP49Q70CQ1 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USP49Q70CQ1 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USP49Q70CQ1 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USP49Q70CQ1 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USP49Q70CQ1 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.27□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
USP49Q70CQ1 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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USP49Q70CQ1 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
USP49Q70CQ1 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
USP49Q70CQ1 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
USP49Q70CQ1 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USP49Q70CQ1 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USP49Q70CQ1 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USP49Q70CQ1 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
USP49Q70CQ1 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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