Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ZNF239Q16600 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ZNF239Q16600 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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