Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SQSTM1Q13501 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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SQSTM1Q13501 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SQSTM1Q13501 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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SQSTM1Q13501 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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SQSTM1Q13501 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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SQSTM1Q13501 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SQSTM1Q13501 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SQSTM1Q13501 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SQSTM1Q13501 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SQSTM1Q13501 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SQSTM1Q13501 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SQSTM1Q13501 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SQSTM1Q13501 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SQSTM1Q13501 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SQSTM1Q13501 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SQSTM1Q13501 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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