Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RPA4Q13156 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RPA4Q13156 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RPA4Q13156 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.31□□□□□ -2.62
RPA4Q13156 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RPA4Q13156 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RPA4Q13156 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RPA4Q13156 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RPA4Q13156 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RPA4Q13156 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RPA4Q13156 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RPA4Q13156 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RPA4Q13156 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RPA4Q13156 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RPA4Q13156 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RPA4Q13156 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RPA4Q13156 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RPA4Q13156 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
RPA4Q13156 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
RPA4Q13156 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
RPA4Q13156 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
RPA4Q13156 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RPA4Q13156 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RPA4Q13156 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RPA4Q13156 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RPA4Q13156 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
RPA4Q13156 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
RPA4Q13156 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
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